Selain prestasi di level Asia, Shin Tae-yong juga membawa Timnas Indonesia meraih hasil positif di turnamen regional.
Timnas senior menjadi runner-up Piala AFF 2020 dan meraih medali perunggu di SEA Games 2021.
Di level U-23, Timnas Indonesia juga menjadi runner-up Piala AFF U-23 2023, menunjukkan konsistensi tim asuhan Shin Tae-yong dalam bersaing di Asia Tenggara.